Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPAG4Q9NPE6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms