Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-5Q9HDB9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-5Q9HDB9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms