Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KIAA1549Q9HCM3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms