Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BCAS3Q9H6U6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BCAS3Q9H6U6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms