Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MED28Q9H204 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms