Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms