Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTNAP4Q9C0A0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTNAP4Q9C0A0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms