Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRCC1Q9C099 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms