Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP4Q9BZE4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms