Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC4A5Q9BY07 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms