Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CARD11Q9BXL7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CARD11Q9BXL7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms