Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB11FIP5Q9BXF6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms