Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRDL1Q9BU40 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRDL1Q9BU40 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRDL1Q9BU40 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRDL1Q9BU40 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms