Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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