Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYCBPQ99417 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYCBPQ99417 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms