Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAMKK2Q96RR4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMKK2Q96RR4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms