Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP4Q96PP9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP4Q96PP9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms