Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP3Q96P20 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP3Q96P20 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms