Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COG8Q96MW5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COG8Q96MW5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms