Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL15Q96M94 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL15Q96M94 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms