Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD1Q96JS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms