Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A4AQ96JQ5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A4AQ96JQ5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms