Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LRIG1Q96JA1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LRIG1Q96JA1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms