Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC34Q96HJ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC34Q96HJ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms