Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIN37Q96GY3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIN37Q96GY3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms