Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEIL1Q96FI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEIL1Q96FI4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms