Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RNFT2Q96EX2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms