Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC10A4Q96EP9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms