Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNRQ92752 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TNRQ92752 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNRQ92752 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNRQ92752 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TNRQ92752 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNRQ92752 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms