Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALLDQ8WX93 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms