Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms