Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
FAT3Q8TDW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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FAT3Q8TDW7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
FAT3Q8TDW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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