Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APCDD1LQ8NCL9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms