Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AVL9Q8NBF6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AVL9Q8NBF6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms