Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms