Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS8Q8N3P4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS8Q8N3P4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms