Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CABP7Q86V35 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CABP7Q86V35 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms