Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP54Q7Z3B4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP54Q7Z3B4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms