Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MICAL3Q7RTP6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MICAL3Q7RTP6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms