Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TOM1L2Q6ZVM7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms