Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPB1

cDNA FLJ26142 fis, clone TST04526, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZPB1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q6ZPB1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms