Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE3Q6ZMZ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE3Q6ZMZ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms