Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPTE2Q6XPS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPTE2Q6XPS3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms