Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED9Q6R2W3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED9Q6R2W3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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