Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CDC45-204ENST00000428937 577 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 35
PRPF8Q6P2Q9 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 515.59■□□□□ 0.098e-8■■■■■ 35
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PRPF8Q6P2Q9 WASHC4-208ENST00000550053 5819 ntTSL 55.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 35
PRPF8Q6P2Q9 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 35
PRPF8Q6P2Q9 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 35
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PRPF8Q6P2Q9 DROSHA-207ENST00000507438 860 ntTSL 48.08□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 35
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PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 34.9
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PRPF8Q6P2Q9 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 54.09□□□□□ -1.761e-8■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 512.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-217ENST00000545595 1615 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-218ENST00000585385 976 ntTSL 510.51□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 29.8□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-201ENST00000321105 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-217ENST00000584582 3661 ntTSL 59.7□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-208ENST00000542570 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-214ENST00000582981 3239 ntTSL 28.3□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-209ENST00000580095 2929 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-9■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 RBM25-209ENST00000531500 1039 ntTSL 39.15□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 34.9
PRPF8Q6P2Q9 RBM25-203ENST00000525321 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-9■■■■■ 34.9
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