Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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RINT1Q6NUQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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RINT1Q6NUQ1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RINT1Q6NUQ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms