Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPW1

C11orf71, Uncharacterized protein C11orf71, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf71Q6IPW1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C11orf71Q6IPW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf71Q6IPW1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms