Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCTP1Q6DN14 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCTP1Q6DN14 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms