Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIRMAQ69YN4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIRMAQ69YN4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms