Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHEQ5VZ18 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms